Сао Мигел дас Мисойнс (на португалски: São Miguel das Missões, IPA: [sɐ̃w̃ miˈgɛw das misˈõȷ̃s]) е град — община в северозападната част на бразилския щат Рио Гранди до Сул. Общината е част от икономико-статистическия микрорегион Санто Анжело, мезорегион Северозападен Рио Гранди. Населението на общината към 2010 г. е 7 421 души, а територията е 1 229.844 km² (6 д./km²).
В Сао Мигел дас Мисойнс се намира Археологическия резерват Сао Мигел Арканжо, на чиято територия се намират останките от йезуитската редукция „Сао Мигел Арканжо“. През 1983 г. са обявени за световно наследство от ЮНЕСКО.
Резерватът разполага с Музей на мисиите, в който се съхраняват религиозни статуи, направени от индианците гуарани.